ระบบทางเดินอาหารประกอบด้วยโครงสร้างที่เป็นท่อตั้งแต่ช่องปากจนถึงทวารหนัก รวมทั้งต่อมต่างๆ เช่น ต่อมน้ำลาย ตับ ตับอ่อน ซึ่งแต่ละโครงสร้างมีบทบาทหน้าที่ที่แตกต่างกัน การย่อยอาหารประกอบด้วย 2 ประเภท ได้แก่ การย่อยเชิงกลเป็นการบดเคี้ยว หรือการบีบตัวของกระเพาะอาหารและลำไส้ ส่วนการย่อยทางเคมีต้องอาศัยเอนไซม์ช่วยย่อยการย่อยอาหารให้สมบูรณ์นั้นต้องมีการเคลื่อนไหวของลำไส้และการหลั่งน้ำย่อยหรือสารเมือกที่เหมาะสม โดยถูกควบคุมจากระบบประสาททั้งที่สั่งการได้และระบบประสาทอัตโนมัติโดยมีหลายระดับ เช่น cephalic, gastric และ intestinal phases นอกจากนี้ต้องอาศัยฮอร์โมนและจุลชีพประจำถิ่นในทางเดินอาหารด้วย

    การย่อยอาหารประเภทต่างๆ นั้น มีการย่อยและการดูดซึมที่แตกต่างกัน เช่น คาร์โบไฮเดรตเริ่มถูกย่อยจากการบดเคี้ยวและเอนไซม์ amylase ในปาก ถูกย่อยต่อที่ลำไส้เล็กจากนั้นถูกดูดซึ่มในรูปของ monosaccharide สำหรับโปรตีนเริ่มถูกย่อยในกระเพาะอาหารกับลำไส้เล็ก ถูกดูดซึมในรูปของ amino acid และ di-tripeptides สำหรับไขมันถูกย่อยในกระเพาะอาหารกับลำไส้เล็กจะได้ไขมันขนาดเล็กจับกันเป็น micelle ถึงจะถูกดูดซึมเข้าสู่กระแสเลือด สำหรับตับเป็นโครงสร้างที่มีขนาดใหญ่อยู่ในช่องท้อง มีบทบาทหลายอย่าง เช่น ช่วยในการย่อยไขมัน เป็นแหล่งเมแทบอลิซึมของสารอาหาร (น้ำตาล โปรตีน ไขมัน) กำจัดสารพิษ และสะสมพลังงาน รวมทั้งแร่ธาตุกับวิตามิน ถ้ามีพยาธิสภาพของตับจะทำให้สูญเสียหน้าที่ไป อาจเป็นบางส่วนหรือทั้งหมดขึ้นกับชนิดและประเภทของพยาธิสภาพ เมื่อมีพยาธิสภาพทางเดินอาหาร จะมีอาการ/อาการแสดงได้หลายลักษณะ เช่น ปวดท้อง ท้องเสีย ท้องผูก ลำไส้อุดตัน ถ่ายเป็นเลือด อาเจียน ซึ่งอาการเหล่านี้อาจเป็นอาการร่วมหรือเป็นอาการของโรคใดโรคหนึ่งโดยเฉพาะ

บทที่ 1 ระบบทางเดินอาหาร
บทที่ 2 โครงสร้างในช่องปาก
บทที่ 3 มหกายวิภาคของทางเดินอาหารที่เป็นท่อ
บทที่ 4 จุลกายวิภาคของทางเดินอาหาร
บทที่ 5 กะบังลมและเยื่อบุช่องท้อง
บทที่ 6 ระบบประสาทอัตโนมัติในช่องท้อง
บทที่ 7 การพัฒนาการของระบบทางเดินอาหาร
บทที่ 8 การทำงานของกล้ามเนื้อทางเดินอาหาร
บทที่ 9 การย่อยและการดูซึม
ฯลฯ