"โจวกงจิน" หนึ่งในผู้บงการคดี "พาราไซดอลล์" ที่เกิดขึ้นเบื้องหลัง "ศึกเก้าโรงเรียน" หลบหนีจากโยโกฮามะ ไปซ่อนตัวอยู่กับกลุ่มจอมขมังเวทโบราณ "สายประเพณี" ที่มีศูนย์กลางอยู่ที่เกียวโตและสองเดือนก็ได้ผ่านพ้นไปฤดูกาลของ "การประกวดวิทยานิพนธ์โรงเรียนมัธยมปลายสายเวทมนตร์ทั่วประเทศ" ก็ได้มาถึง พวกนักเรียนโรงเรียนมัธยมปลายที่หนึ่งต่างก็วุ่นวายไปกับการเตรียม "ประกวดวิทยานิพนธ์" ซึ่งสนับสนุนโดยสมาพันธ์เวทมนตร์ญี่ปุ่น และจะจัดขึ้นที่ศูนย์ประชุมนานาชาติเกียวโตใหม่ ในระหว่างนั้นสองพี่น้องคุโรบะที่ถือจดหมายจากโยตสึบะ มายะ ก็มาเยือน เนื้อความในจดหมายนั้นเรียกร้องว่า "อยากจะให้ช่วยจับกุมโจวกงจิน" 

    แม้จะคลางแคลงว่าเหตุใดจึง "ไหว้วาน" แทนที่จะ "ออกคำสั่ง" อย่างที่เคย ทัตสึยะและมิยูกิก็มุ่งหน้าไปยังบ้านคุโดที่เป็นศูนย์กลางในการต่อต้านกองกำลังของพวก "สายประเพณี" และที่นั่น ทั้งคู่ก็ได้พบกันด้วยโชคชะตากับ "จอมขมังเวทอัจฉริยะที่ถูกสร้างสรรค์" ...ทัตสึยะกับมิยูกิ และเพื่อนพ้องกำลังเผชิญหน้าท้าทายกับแผนร้าย รวมถึงความอาฆาตแค้นที่อยู่เบื้องหลังประวัติศาสตร์การพัฒนาจอมขมังเวท โดยมีนครเก่าเป็นสังเวียน!?